유전체 분석과 표현형 데이터를 통합해, 유전자 변이가 실제 형질·질병·생육 특성으로 어떻게 이어지는지 그 연결고리를 규명합니다.
About GenePhenomics
생명체의 DNA·RNA를 해독하는 유전체 분석 기술을 기반으로, 유전 변이와 발현 정보를 실제 표현형(형질·질병·생육 특성)과 연결합니다. 미생물부터 동식물, 인간까지 — 유전형–표현형 연관을 규명해 연구와 산업에 필요한 정보를 발굴합니다.
NGS Research
발굴 → 해석 → 검증으로 이어지는 전 과정을 NGS로 연결하고, 연구 목적에 맞춘 분석 설계를 함께 제안합니다
연구 목적에 따라 유전체를 완전히 해독하고(genome) → 발현·기능을 분석하며(transcriptome) → 위치까지 규명하는 공간전사체(spatial) 세 축으로 데이터를 생산하고, 그 결과를 표현형(phenotype)과 연결해 해석합니다. (주)진피노믹스는 유전형–표현형 연관 규명에 최적화된 전략을 제안합니다.
배양 균주 한 개체부터 배양이 어려운 환경 시료 전체까지, 미생물 유전체를 빈틈없이 '닫힌' 완결형으로 마무리합니다.
유전자가 언제·어디서·얼마나 켜지는지, 전사체와 후성유전체로 발현의 작동 원리를 읽어냅니다.
조직 절편에서 위치 정보를 유지한 채 유전자 발현을 측정해, 어떤 세포가 어디서 무엇을 발현하는지 규명합니다.
Services
(주)진피노믹스가 제공하는 유전체·표현형 분석 서비스를 소개합니다
장리드(long-read)와 단리드(short-read)를 결합해 염색체·플라스미드까지 완결한 complete genome을 완성합니다. 장리드로 반복·구조 영역을 관통해 골격을 세우고, 고정확 단리드로 염기 오류를 교정(polishing)합니다. 균주당 각 100× 내외 심도로 데이터를 생산하며, hybrid de novo 조립 → 오류 교정 → 원형(circular) 확인까지 수행합니다. 완성 유전체는 단일 contig·갭 없는 reference-grade 품질로 마무리합니다. 이어 유전자 예측·기능 주석(annotation)과 필요 시 비교유전체 분석까지 제공합니다. 배양 균주뿐 아니라 환경 시료의 whole metagenome 조립에도 동일한 전략을 적용합니다.
mRNA·small RNA·non-coding RNA를 시퀀싱해 유전자 발현을 정량하고 발현 변화를 규명합니다. 조건·조직·발달 단계·처리군 간 차등발현유전자(DEG)를 통계적으로(padj<0.05, |log2FC|≥1) 도출합니다. GO·KEGG 경로 분석으로 활성화·억제되는 생물학적 기능을 해석하고, 대체 스플라이싱·isoform·신규 전사체까지 확인합니다. 시계열 발현 패턴 클러스터링으로 분화·반응 과정의 핵심 조절자 유전자를 발굴합니다. 단일세포 전사체(scRNA-seq)로 세포 유형별 발현 프로파일도 지원하며, 질환·표현형 특이 바이오마커 후보 제안까지 연결합니다.
조직 절편의 공간 좌표를 보존한 채 전사체를 시퀀싱해 조직 구조와 발현을 함께 규명합니다. 플랫폼(Visium·Visium HD·Xenium·GeoMx)을 목적에 맞게 선택하고, QC → 스팟·세포 정렬 → 정규화 → 클러스터링 → 공간 도메인 규명까지 수행합니다. 단일세포 참조와 통합해 스팟 내 세포유형 조성을 추정(deconvolution)하고, 공간적 차등발현 유전자·조직 영역 비교·세포–세포(리간드–수용체) 상호작용을 분석해 병변/정상 미세환경의 차이를 표현형과 연결합니다.
Technologies
진피노믹스가 수행하는 각 분석의 생물정보학 파이프라인을 단계별로 소개합니다
장·단리드를 결합해 갭 없는 완결형 유전체(complete genome)와 고품질 MAG를 복원합니다.
발현량 정량과 차등발현유전자(DEG)를 도출하고 GO·KEGG로 기능을 해석합니다.
조직 내 위치를 유지한 채 발현을 측정해 공간 도메인·세포유형 지도·공간 차등발현을 규명합니다.
메틸화 수준을 정량해 차등 메틸화 영역(DMR)을 도출하고 생체나이 등 통합 해석에 연결합니다.
변이 검출·주석부터 집단분석·GWAS·PGS까지 유전형 기반 형질 예측을 수행합니다.
다중 오믹스와 표현형·임상 데이터를 통합해 연관을 규명하고 예측 모델·리포트로 연결합니다.
Contact
궁금하신 사항이 있으시면 언제든 문의해 주십시오. 빠르게 회신드리겠습니다.